IvanChurilov/E01_textural_features_blast_pipeline
1
0
Fork 0
Code Issues Pull Requests Actions Packages Projects Releases Wiki Activity

пофиксил README

Browse Source
This commit is contained in:
IvanChurilov
2026-09-11 08:35:07 +03:00
parent 1f9b2f20bd
commit 5fc8edfe16
2 changed files with 6 additions and 22 deletions
Download Patch File Download Diff File Expand all files Collapse all files
README.md
+3 -14
View File
@@ -2,7 +2,7 @@
## Постановка задачи
Проверить, насколько интерпретируемые морфометрические, цветовые и текстурные признаки действительно полезны для автоматизированного обнаружения бластных клеток на микроскопических изображениях препаратов крови, если оценка проводится на реальных данных с разметкой объектов, масками и разделением по пациентам.
Проверка, насколько интерпретируемые морфометрические, цветовые и текстурные признаки действительно полезны для автоматизированного обнаружения бластных клеток на микроскопических изображениях препаратов крови, если оценка проводится на реальных данных с разметкой объектов, масками и разделением по пациентам.
## Предмет проекта
@@ -12,17 +12,6 @@
- переход от классификации отдельного объекта к анализаторно-ориентированной оценке изображения;
- фиксация ограничений текущих данных и выделение задач, требующих нового корпуса.
## Текущий фокус
На первом этапе приоритет отдается только тем частям исследования, которые можно выполнить на локальных данных.
- object detection-разметка по пациентам;
- автоматически построенные маски объектов;
- patient-level разбиение;
- морфо-текстурные признаки на уровне отдельных клеток;
- image-level агрегирование как приближение к задаче автоматического анализатора.
Постановки, требующие явного разделения лимфобластов и миелобластов, внешней межлабораторной валидации и case-level клинических меток, вынесены во вторую часть плана.
## Навигация по проекту
@@ -174,6 +163,6 @@ make h5
- Основная постановка для текущих данных: `blast vs non-blast`, а не `lymphoblast vs myeloblast`.
- Главная единица недопущения утечки: пациент.
- В базовый patient-level протокол входят только `122` каталогов с patient id; специальный каталог `part-1` пока рассматривается отдельно до уточнения его происхождения.
- В базовый patient-level протокол входят только `122` каталогов с patient id;
- Основной сопоставитель объектов: порядок строк в `images_labels/*.txt` и индекс `obj_XXXX` в имени маски.
- Первичная научная ценность текущего корпуса: воспроизводимая проверка полезности текстурных признаков, влияния масок и реалистичных условий data quality.
- Научная ценность текущего экспериента: воспроизводимая проверка полезности текстурных признаков, влияния масок и реалистичных условий data quality.